Update polybius

.gitignore

@@ -1,5 +1,4 @@
-**.txt.crypt
-**.txt.decrypt
-**.txt.**
-**.txt
 main
+examples/**crypt
+examples/**decrypt
+**swp

examples/poem.txt

@@ -0,0 +1,139 @@
+Ô saint prêtre ! grande âme ! oh ! je tombe à genoux !
+Jeune, il avait encor de longs jours parmi nous,
+Il n'en a pas compté le nombre ;
+Il était à cet âge où le bonheur fleurit ;
+Il a considéré la croix de Jésus-Christ
+Toute rayonnante dans l'ombre.
+
+Il a dit : — « C'est le Dieu de progrès et d'amour.
+Jésus, qui voit ton front croit voir le front du jour.
+Christ sourit à qui le repousse.
+Puisqu'il est mort pour nous, je veux mourir pour lui ;
+Dans son tombeau, dont j'ai la pierre pour appui,
+Il m'appelle d'une voix douce.
+
+« Sa doctrine est le ciel entr'ouvert ; par la main,
+Comme un père l'enfant, il tient le genre humain ;
+Par lui nous vivons et nous sommes ;
+Au chevet des geôliers dormant dans leurs maisons,
+Il dérobe les clefs de toutes les prisons
+Et met en liberté les hommes.
+
+« Or il est, loin de nous, une autre humanité
+Qui ne le connaît point, et dans l'iniquité
+Rampe enchaînée, et souffre et tombe ;
+Ils font pour trouver Dieu de ténébreux efforts ;
+Ils s'agitent en vain ; ils sont comme des morts
+Qui tâtent le mur de leur tombe.
+
+« Sans loi, sans but, sans guide, ils errent ici-bas.
+Ils sont méchants, étant ignorants ; ils n'ont pas
+Leur part de la grande conquête.
+J'irai. Pour les sauver je quitte le saint lieu.
+Ô mes frères, je viens vous apporter mon Dieu,
+Je viens vous apporter ma tête ! » —
+
+Prêtre, il s'est souvenu, calme en nos jours troublés,
+De la parole dite aux apôtres : — Allez,
+Bravez les bûchers et les claies ! —
+Et de l'adieu du Christ au suprême moment :
+— Ô vivant, aimez-vous ! aimez. En vous aimant,
+Frères, vous fermerez mes plaies. —
+
+Il s'est dit qu'il est bon d'éclairer dans leur nuit
+Ces peuples égarés loin du progrès qui luit,
+Dont l'âme est couverte de voiles ;
+Puis il s'en est allé, dans les vents, dans les flots,
+Vers les noirs chevalets et les sanglants billots,
+Les yeux fixés sur les étoiles.
+
+II.
+
+Ceux vers qui cet apôtre allait, l'ont égorgé.
+
+III.
+
+Oh ! tandis que là-bas, hélas ! chez ces barbares,
+S'étale l'échafaud de tes membres chargé,
+Que le bourreau, rangeant ses glaives et ses barres,
+Frotte au gibet son ongle où ton sang s'est figé ;
+
+Ciel ! tandis que les chiens dans ce sang viennent boire,
+Et que la mouche horrible, essaim au vol joyeux,
+Comme dans une ruche entre en ta bouche noire
+Et bourdonne au soleil dans les trous de tes yeux ;
+
+Tandis qu'échevelée, et sans voix, sans paupières,
+Ta tête blême est là sur un infâme pieu,
+Livrée aux vils affronts, meurtrie à coups de pierres,
+Ici, derrière toi, martyr, on vend ton Dieu !
+
+Ce Dieu qui n'est qu'à toi, martyr, on te le vole !
+On le livre à Mandrin, ce Dieu pour qui tu meurs !
+Des hommes, comme toi revêtus de l'étole,
+Pour être cardinaux, pour être sénateurs,
+
+Des prêtres, pour avoir des palais, des carrosses,
+Et des jardins l'été riant sous le ciel bleu,
+Pour argenter leur mitre et pour dorer leurs crosses,
+Pour boire de bon vin, assis près d'un bon feu,
+
+Au forban dont la main dans le meurtre est trempée,
+Au larron chargé d'or qui paye et qui sourit,
+Grand Dieu ! retourne-toi vers nous, tête coupée !
+Ils vendent Jésus-Christ ! ils vendent Jésus-Christ !
+
+Ils livrent au bandit, pour quelques sacs sordides,
+L'évangile, la loi, l'autel épouvanté,
+Et la justice aux yeux sévères et candides,
+Et l'étoile du coeur humain, la vérité !
+
+Les bons jetés, vivants, au bagne, ou morts, aux fleuves,
+L'homme juste proscrit par Cartouche Sylla,
+L'innocent égorgé, le deuil sacré des veuves,
+Les pleurs de l'orphelin, ils vendent tout cela !
+
+Tout ! la foi, le serment que Dieu tient sous sa garde,
+Le saint temple où, mourant, tu dis :Introïbo,
+Ils livrent tout ! pudeur, vertu ! — martyr, regarde,
+Rouvre tes yeux qu'emplit la lueur du tombeau ; —
+
+Ils vendent l'arche auguste où l'hostie étincelle !
+Ils vendent Christ, te dis-je ! et ses membres liés !
+Ils vendent la sueur qui sur son front ruisselle,
+Et les clous de ses mains, et les clous de ses pieds !
+
+Ils vendent au brigand qui chez lui les attire
+Le grand crucifié sur les hommes penché ;
+Ils vendent sa parole, ils vendent son martyre,
+Et ton martyre à toi par-dessus le marché !
+
+Tant pour les coups de fouet qu'il reçut à la porte !
+César ! tant pour l'amen, tant pour l'alléluia !
+Tant pour la pierre où vint heurter sa tête morte !
+Tant pour le drap rougi que sa barbe essuya !
+
+Ils vendent ses genoux meurtris, sa palme verte,
+Sa plaie au flanc, son oeil tout baigné d'infini,
+Ses pleurs, son agonie, et sa bouche entrouverte,
+Et le cri qu'il poussa : Lamma Sabacthani !
+
+Ils vendent le sépulcre ! ils vendent les ténèbres !
+Les séraphins chantant au seuil profond des cieux,
+Et la mère debout sous l'arbre aux bras funèbres,
+Qui, sentant là son fils, ne levait pas les yeux !
+
+Oui, ces évêques, oui, ces marchands, oui, ces prêtres
+A l'histrion du crime, assouvi, couronné,
+A ce Néron repu qui rit parmi les traîtres,
+Un pied sur Thraséas, un coude sur Phryné,
+
+Au voleur qui tua les lois à coups de crosse,
+Au pirate empereur Napoléon dernier,
+Ivre deux fois, immonde encor plus que féroce,
+Pourceau dans le cloaque et loup dans le charnier,
+
+Ils vendent, ô martyr, le Dieu pensif et pâle
+Qui, debout sur la terre et sous le firmament,
+Triste et nous souriant dans notre nuit fatale,
+Sur le noir Golgotha saigne éternellement !

examples/poem.txt.crypt.decrypt

@@ -0,0 +1,139 @@
+Ô SAINT PRêTRE ! GRANDE âME ! OH ! JE TOMBE à GENOUX !
+JEUNE, IL AVAIT ENCOR DE LONGS JOURS PARMI NOUS,
+IL N'EN A PAS COMPTé LE NOMBRE ;
+IL éTAIT à CET âGE Où LE BONHEUR FLEURIT ;
+IL A CONSIDéRé LA CROIX DE JéSUS-CHRIST
+TOUTE RAYONNANTE DANS L'OMBRE.
+
+IL A DIT : — « C'EST LE DIEU DE PROGRèS ET D'AMOUR.
+JéSUS, QUI VOIT TON FRONT CROIT VOIR LE FRONT DU JOUR.
+CHRIST SOURIT à QUI LE REPOUSSE.
+PUISQU'IL EST MORT POUR NOUS, JE VEUX MOURIR POUR LUI ;
+DANS SON TOMBEAU, DONT J'AI LA PIERRE POUR APPUI,
+IL M'APPELLE D'UNE VOIX DOUCE.
+
+« SA DOCTRINE EST LE CIEL ENTR'OUVERT ; PAR LA MAIN,
+COMME UN PèRE L'ENFANT, IL TIENT LE GENRE HUMAIN ;
+PAR LUI NOUS VIVONS ET NOUS SOMMES ;
+AU CHEVET DES GEôLIERS DORMANT DANS LEURS MAISONS,
+IL DéROBE LES CLEFS DE TOUTES LES PRISONS
+ET MET EN LIBERTé LES HOMMES.
+
+« OR IL EST, LOIN DE NOUS, UNE AUTRE HUMANITé
+QUI NE LE CONNAîT POINT, ET DANS L'INIQUITé
+RAMPE ENCHAîNéE, ET SOUFFRE ET TOMBE ;
+ILS FONT POUR TROUVER DIEU DE TéNéBREUX EFFORTS ;
+ILS S'AGITENT EN VAIN ; ILS SONT COMME DES MORTS
+QUI TâTENT LE MUR DE LEUR TOMBE.
+
+« SANS LOI, SANS BUT, SANS GUIDE, ILS ERRENT ICI-BAS.
+ILS SONT MéCHANTS, éTANT IGNORANTS ; ILS N'ONT PAS
+LEUR PART DE LA GRANDE CONQUêTE.
+J'IRAI. POUR LES SAUVER JE QUITTE LE SAINT LIEU.
+Ô MES FRèRES, JE VIENS VOUS APPORTER MON DIEU,
+JE VIENS VOUS APPORTER MA TêTE ! » —
+
+PRêTRE, IL S'EST SOUVENU, CALME EN NOS JOURS TROUBLéS,
+DE LA PAROLE DITE AUX APôTRES : — ALLEZ,
+BRAVEZ LES BûCHERS ET LES CLAIES ! —
+ET DE L'ADIEU DU CHRIST AU SUPRêME MOMENT :
+— Ô VIVANT, AIMEZ-VOUS ! AIMEZ. EN VOUS AIMANT,
+FRèRES, VOUS FERMEREZ MES PLAIES. —
+
+IL S'EST DIT QU'IL EST BON D'éCLAIRER DANS LEUR NUIT
+CES PEUPLES éGARéS LOIN DU PROGRèS QUI LUIT,
+DONT L'âME EST COUVERTE DE VOILES ;
+PUIS IL S'EN EST ALLé, DANS LES VENTS, DANS LES FLOTS,
+VERS LES NOIRS CHEVALETS ET LES SANGLANTS BILLOTS,
+LES YEUX FIXéS SUR LES éTOILES.
+
+II.
+
+CEUX VERS QUI CET APôTRE ALLAIT, L'ONT éGORGé.
+
+III.
+
+OH ! TANDIS QUE Là-BAS, HéLAS ! CHEZ CES BARBARES,
+S'éTALE L'éCHAFAUD DE TES MEMBRES CHARGé,
+QUE LE BOURREAU, RANGEANT SES GLAIVES ET SES BARRES,
+FROTTE AU GIBET SON ONGLE Où TON SANG S'EST FIGé ;
+
+CIEL ! TANDIS QUE LES CHIENS DANS CE SANG VIENNENT BOIRE,
+ET QUE LA MOUCHE HORRIBLE, ESSAIM AU VOL JOYEUX,
+COMME DANS UNE RUCHE ENTRE EN TA BOUCHE NOIRE
+ET BOURDONNE AU SOLEIL DANS LES TROUS DE TES YEUX ;
+
+TANDIS QU'éCHEVELéE, ET SANS VOIX, SANS PAUPIèRES,
+TA TêTE BLêME EST Là SUR UN INFâME PIEU,
+LIVRéE AUX VILS AFFRONTS, MEURTRIE à COUPS DE PIERRES,
+ICI, DERRIèRE TOI, MARTYR, ON VEND TON DIEU !
+
+CE DIEU QUI N'EST QU'à TOI, MARTYR, ON TE LE VOLE !
+ON LE LIVRE à MANDRIN, CE DIEU POUR QUI TU MEURS !
+DES HOMMES, COMME TOI REVêTUS DE L'éTOLE,
+POUR êTRE CARDINAUX, POUR êTRE SéNATEURS,
+
+DES PRêTRES, POUR AVOIR DES PALAIS, DES CARROSSES,
+ET DES JARDINS L'éTé RIANT SOUS LE CIEL BLEU,
+POUR ARGENTER LEUR MITRE ET POUR DORER LEURS CROSSES,
+POUR BOIRE DE BON VIN, ASSIS PRèS D'UN BON FEU,
+
+AU FORBAN DONT LA MAIN DANS LE MEURTRE EST TREMPéE,
+AU LARRON CHARGé D'OR QUI PAYE ET QUI SOURIT,
+GRAND DIEU ! RETOURNE-TOI VERS NOUS, TêTE COUPéE !
+ILS VENDENT JéSUS-CHRIST ! ILS VENDENT JéSUS-CHRIST !
+
+ILS LIVRENT AU BANDIT, POUR QUELQUES SACS SORDIDES,
+L'éVANGILE, LA LOI, L'AUTEL éPOUVANTé,
+ET LA JUSTICE AUX YEUX SéVèRES ET CANDIDES,
+ET L'éTOILE DU COEUR HUMAIN, LA VéRITé !
+
+LES BONS JETéS, VIVANTS, AU BAGNE, OU MORTS, AUX FLEUVES,
+L'HOMME JUSTE PROSCRIT PAR CARTOUCHE SYLLA,
+L'INNOCENT éGORGé, LE DEUIL SACRé DES VEUVES,
+LES PLEURS DE L'ORPHELIN, ILS VENDENT TOUT CELA !
+
+TOUT ! LA FOI, LE SERMENT QUE DIEU TIENT SOUS SA GARDE,
+LE SAINT TEMPLE Où, MOURANT, TU DIS :INTROïBO,
+ILS LIVRENT TOUT ! PUDEUR, VERTU ! — MARTYR, REGARDE,
+ROUVRE TES YEUX QU'EMPLIT LA LUEUR DU TOMBEAU ; —
+
+ILS VENDENT L'ARCHE AUGUSTE Où L'HOSTIE éTINCELLE !
+ILS VENDENT CHRIST, TE DIS-JE ! ET SES MEMBRES LIéS !
+ILS VENDENT LA SUEUR QUI SUR SON FRONT RUISSELLE,
+ET LES CLOUS DE SES MAINS, ET LES CLOUS DE SES PIEDS !
+
+ILS VENDENT AU BRIGAND QUI CHEZ LUI LES ATTIRE
+LE GRAND CRUCIFIé SUR LES HOMMES PENCHé ;
+ILS VENDENT SA PAROLE, ILS VENDENT SON MARTYRE,
+ET TON MARTYRE à TOI PAR-DESSUS LE MARCHé !
+
+TANT POUR LES COUPS DE FOUET QU'IL REçUT à LA PORTE !
+CéSAR ! TANT POUR L'AMEN, TANT POUR L'ALLéLUIA !
+TANT POUR LA PIERRE Où VINT HEURTER SA TêTE MORTE !
+TANT POUR LE DRAP ROUGI QUE SA BARBE ESSUYA !
+
+ILS VENDENT SES GENOUX MEURTRIS, SA PALME VERTE,
+SA PLAIE AU FLANC, SON OEIL TOUT BAIGNé D'INFINI,
+SES PLEURS, SON AGONIE, ET SA BOUCHE ENTROUVERTE,
+ET LE CRI QU'IL POUSSA : LAMMA SABACTHANI !
+
+ILS VENDENT LE SéPULCRE ! ILS VENDENT LES TéNèBRES !
+LES SéRAPHINS CHANTANT AU SEUIL PROFOND DES CIEUX,
+ET LA MèRE DEBOUT SOUS L'ARBRE AUX BRAS FUNèBRES,
+QUI, SENTANT Là SON FILS, NE LEVAIT PAS LES YEUX !
+
+OUI, CES éVêQUES, OUI, CES MARCHANDS, OUI, CES PRêTRES
+A L'HISTRION DU CRIME, ASSOUVI, COURONNé,
+A CE NéRON REPU QUI RIT PARMI LES TRAîTRES,
+UN PIED SUR THRASéAS, UN COUDE SUR PHRYNé,
+
+AU VOLEUR QUI TUA LES LOIS à COUPS DE CROSSE,
+AU PIRATE EMPEREUR NAPOLéON DERNIER,
+IVRE DEUX FOIS, IMMONDE ENCOR PLUS QUE FéROCE,
+POURCEAU DANS LE CLOAQUE ET LOUP DANS LE CHARNIER,
+
+ILS VENDENT, ô MARTYR, LE DIEU PENSIF ET PâLE
+QUI, DEBOUT SUR LA TERRE ET SOUS LE FIRMAMENT,
+TRISTE ET NOUS SOURIANT DANS NOTRE NUIT FATALE,
+SUR LE NOIR GOLGOTHA SAIGNE éTERNELLEMENT !

examples/sonnet116.txt

@@ -0,0 +1,16 @@
+Let me not to the marriage of true minds
+Admit impediments. Love is not love
+Which alters when it alteration finds,
+Or bends with the remover to remove:
+O no! it is an ever-fixed mark
+That looks on tempests and is never shaken;
+It is the star to every wandering bark,
+Whose worth’s unknown, although his height be taken.
+Love’s not Time’s fool, though rosy lips and cheeks
+Within his bending sickle’s compass come:
+Love alters not with his brief hours and weeks,
+But bears it out even to the edge of doom.
+If this be error and upon me proved,
+I never writ, nor no man ever loved. 
+
+William Shakespeare

exec.sh

@@ -1,3 +1,3 @@
 #!/bin/sh
 
-gcc -W src/main.c src/functions.c src/caesar.c src/vigenere.c -o output/main && ./output/main $1 $2 $3 $4
+gcc -Wall src/main.c src/functions.c src/caesar.c src/vigenere.c src/polybius.c -o main && ./main $1 $2 $3 $4

src/caesar.c

@@ -1,51 +1,60 @@
 #include "caesar.h"
 
+
 /*
 	s -> path source
 	d -> path destination
 	key -> key of encryption
 	This function encrypt data
 */
-int cryptCaesar(const char *s, const int key, const int countCharact, char *bufferDst) {
-	char *buffer;
+int cryptCaesar(const char *s, const char *filenameDst, const int key) {
 	int i;
-	int error = countCharact;
 	char c = 0;
+    FILE *f = NULL, *fDst = NULL;
+    char data[BUFFER_SIZE];
+    char dataEncrypted[BUFFER_SIZE];
+    int size = 0, end = 0;
 
-	if(error == -1) return error;
+    // Open the file
+    f = fopen(s, "r+");
+    if (f == NULL) return -1;
 
-	/* Allocation dynamique */
-	buffer = malloc(countCharact + 1); /* + 1 for '\0' */
+    fDst = fopen(filenameDst, "w");
+    if (fDst == NULL) {
+        fclose(f);
+        return -1;
+    }
 
-	/* Copy the data of file into the buffer[] */
-	error = copyFile(s, buffer);
-	if(error != 0) return error;
+    // We are going to read the file block by block
+    do {
+        end = readFile(f, &size, data);
 
 	    /********* Encryption **********/
-	for(i = 0; i < countCharact; i++) {
-		int val = 0;
-		/* For characters of A to Z */
-		if(buffer[i] >= 'A' && buffer[i] <= 'Z') {
-			c = buffer[i] - 'A';
-			val = ((c + key) % 26) + 'A';
+        for (i = 0; i < size; i++){
+            if (data[i] >= 'A' && data[i] <= 'Z'){
+                c = data[i] - 'A';
+                dataEncrypted[i] = ((c + key) % 26) + 'A';
             }
-		/* For characters of 'a' to 'z' */
-		else if(buffer[i] >= 'a' && buffer[i] <= 'z') {
-			c = buffer[i] - 'a';
-				val = ((c + key) % 26) + 'A';
+            else if (data[i] >= 'a' && data[i] <= 'z'){
+                c = data[i] - 'a';
+                dataEncrypted[i] = ((c + key) % 26) + 'A';
             }
-		/* For others characters */
-		else val = buffer[i];
+            else dataEncrypted[i] = data[i];
 
-		bufferDst[i] = val;
+            // We can write into the dest file
+            if (dataEncrypted[i] != '\0')
+                fputc(dataEncrypted[i], fDst);
         }
+        size = 0; 
 
-	bufferDst[i] = '\0';
+        memset(data, 0, BUFFER_SIZE);
+        memset(dataEncrypted, 0, BUFFER_SIZE);
+    }while(end != 1);
 
-	/* Freedom the memory */
-	free(buffer);
-
-	return error;
+	/* Close files */
+    fclose(f);
+    fclose(fDst);
+    return 0;
 }
 /*
 	s -> path source
@@ -53,40 +62,51 @@ int cryptCaesar(const char *s, const int key, const int countCharact, char *buff
 	key -> key of decryption
 	This function decryption by Cesar
 */
-int decryptCaesar(const char *s, const int key, const int countCharact, char *bufferDst) {
-	int error = countCharact;
-	char *buffer;
+int decryptCaesar(const char *s, const char *filenameDst, const int key) {
 	int i;
+    FILE *f = NULL, *fDst = NULL;
+    char data[BUFFER_SIZE];
+    char dataDecrypted[BUFFER_SIZE];
+    int size = 0, end = 0;
 
-	if(error == -1)
-		return error;
+    // Open the file
+    f = fopen(s, "r+");
+    if (f == NULL) return -1;
 
-	/* Allocation dynamique */
-	buffer = malloc(countCharact + 1); /* +1 for '\0' */
+    fDst = fopen(filenameDst, "w");
+    if (fDst == NULL) {
+        fclose(f);
+        return -1;
+    }
 
-	/* Copy the data from file into buffer */
-	error = copyFile(s, buffer);
-	if(error != 0) return error;
+    // We are going to read the file block by block
+    do {
+        end = readFile(f, &size, data);
 
 	    /********* Decryption **********/
-	for(i = 0; i < countCharact; i++) {
+        for (i = 0; i < size; i++){
             int val = 0;
-		/* buffer[i] >= 'A' AND buffer[i] <= 'Z' */
-		if(buffer[i] >= 65 && buffer[i] <= 90) {
-			val = buffer[i] - key;
-			/* val < 'A' */
-			if(val < 65)
+            //if (data[i] >= 'A' && data[i] <= 'Z'){
+		    if(data[i] >= 65 && data[i] <= 90) {
+                val = data[i] - key;
+                if (val < 'A')
                     val = val + 26;
             }
-		else
-			val = buffer[i];
-
-		bufferDst[i] = val;
+            else val  = data[i];
+            dataDecrypted[i] = val;
+            // We can write into the dest file
+            if (dataDecrypted[i] != '\0')
+                fputc(dataDecrypted[i], fDst);
         }
-	bufferDst[i] = '\0';
+        size = 0; 
 
-	/* Freedom the memory */
-	free(buffer);
+        memset(data, 0, BUFFER_SIZE);
+        memset(dataDecrypted, 0, BUFFER_SIZE);
+    }while(end != 1);
 
-	return error;
+	/* Close files */
+    fclose(f);
+    fclose(fDst);
+
+	return 0;
 }

src/caesar.h

@@ -6,7 +6,7 @@
 #include "functions.h"
 
 /* Functions */
-int cryptCaesar(const char *s, const int key, const int countCharact, char *bufferDst);
-int decryptCaesar(const char *s, const int key, const int countCharact, char *bufferDst);
+int cryptCaesar(const char *, const char *, const int);
+int decryptCaesar(const char *, const char *, const int);
 
 #endif

src/functions.c

@@ -6,25 +6,49 @@ void usage() {
 	printf("\t-c: Caesar cipher\n");
 	printf("\t-v: Vigenere cipher\n");
 	printf("\t-t: Transposition cipher\n");
+    printf("\t-s: Polybius square\n");
 }
 int fileExist(const char *path) {
 	FILE *f=NULL;
 	f=fopen(path,"r");
 
-	if(f==NULL){
+	if(f==NULL)
 		return -1;
-	}
 	fclose(f);
 	return 0;
 }
+/*
+ This function read the file block by block until the end of it
+ */
+int readFile(FILE *f, int *size, char *buffer){
+    int index = 0;
+    char c;
+    int end = 0;
+
+    do{
+        c = fgetc(f);
+        buffer[index] = c;
+        index++;
+        *size += 1;
+
+        // End of the file, we stop it
+        if (c == EOF){
+            buffer[index - 1] = '\0';
+            index = BUFFER_SIZE;
+            end = 1;
+        }
+    }while(index < BUFFER_SIZE);
+
+    return end;
+}
 /*
 	path -> path source
 	This function copy all characters of the file in the buffer
 */
 int copyFile(const char *path, char *buffer) {
-	FILE *f = fopen(path, "r+");
 	int caract = 0;
 	int i = 0;
+	FILE *f = fopen(path, "r+");
 
 	if(f == NULL) return -1;
 

src/functions.h

@@ -5,8 +5,11 @@
 #include <stdlib.h>
 #include <string.h>
 
+#define BUFFER_SIZE 4096
+
 /* Functions */
 void usage();
+int readFile(FILE *, int *, char *);
 int fileExist(const char *path);
 int copyFile(const char *path, char *buffer);
 int addDataToFile(const char *data, const char *path);

src/main.c

@@ -1,24 +1,24 @@
 #include "functions.h"
 #include "caesar.h"
 #include "vigenere.h"
+#include "polybius.h"
 
 int main(int argc, char *argv[]) {
     int error = 0;
-	int numberCharacters = 0;
-	char *options[3] = {"-c","-v","-t"};
-	char *hook, *fileSrc, *fileDst, *buffer;
+    char *options[4] = {"-c","-v","-t","-s"};
+    char *hook, *fileSrc, *fileDst, *buffer = NULL;
     size_t sFile, i;
 
     if(argc != 4) {
         usage();
+        return -1;
     }
 
-	// Check options
-	for(i = 0; i < 3; i++){
-		if(strcmp(argv[1], options[i]) == 0){
+    // Check kind of encryption
+    for(i = 0; i < 4; i++){
+        if(strcmp(argv[1], options[i]) == 0)
             error++;
     }
-	}
 
     if(error == 0) {
         usage();
@@ -64,17 +64,11 @@ int main(int argc, char *argv[]) {
     fileDst[i++] = 't';
     fileDst[i++] = '\0';
 
-	// Get size of the file
-	numberCharacters = fileNumberCaract(fileSrc);
-
-	// Malloc the dest buffer
-	buffer = malloc(sizeof(int) * numberCharacters);
-	memset(buffer, 0, sizeof(int) * numberCharacters);
-
     // Caesar cipher
     if(strcmp(argv[1], "-c") == 0){
         // Get key
         int key;
+        int res;
 
         do{
             printf("Your key (between 1 and 26): ");
@@ -82,10 +76,14 @@ int main(int argc, char *argv[]) {
         }while(key < 1 || key > 26);
 
         if(strcmp(hook, "crypt") == 0)
-			error = cryptCaesar(fileSrc, key, numberCharacters, buffer);
+            res = cryptCaesar(fileSrc, fileDst, key);
         if(strcmp(hook, "decrypt") == 0)
-			error = decryptCaesar(fileSrc, key, numberCharacters, buffer);
+           res = decryptCaesar(fileSrc, fileDst, key);
+
+        if (res != 0)
+            printf("Failed to encrypt/decrypt the file");
     }
+    // Vigenere
     else if(strcmp(argv[1], "-v") == 0){
         // Get key
         char *key = malloc(8);
@@ -94,16 +92,34 @@ int main(int argc, char *argv[]) {
 
 
         if(strcmp(hook, "crypt") == 0)
-			error = cryptVigenere(key, fileSrc, numberCharacters, buffer);
+            error = cryptVigenere(key, fileSrc, 0, buffer);
 
         free(key);
     }
     else if(strcmp(argv[1], "-t") == 0){
         // Get key
     }
+    // Polybius square
+    else if(strcmp(argv[1], "-s") == 0){
+        char key[26];
+        int res;
 
-	// Add data to file
-	addDataToFile(buffer, fileDst);
+        printf("Your key: ");
+        scanf("%s", key);
+
+        if (strlen(key) > 26){
+            printf("Your key is too big. Choose a small one\n");
+            return -1;    
+        }
+
+        if(strcmp(hook, "crypt") == 0)
+            res = cryptPolybius(fileSrc, fileDst, key);
+        else
+            res = decryptPolybius(fileSrc, fileDst, key);
+
+        if (res != 0)
+            printf("Failed to crypt/decrypt the file\n");
+    }
 
     /* Display error */
     /*
@@ -113,6 +129,5 @@ int main(int argc, char *argv[]) {
      */
 
     free(fileDst);
-	free(buffer);
     return 0;
 }

src/polybius.c

@@ -0,0 +1,174 @@
+#include "polybius.h"
+
+
+int cryptPolybius(const char *filenameSrc, const char *filenameDst, const char *key){
+    char polybius[POLYBIUS_SIZE][POLYBIUS_SIZE];
+    FILE *f = NULL, *fDst = NULL;
+    char data[BUFFER_SIZE];
+    char dataEncrypted[BUFFER_SIZE];
+    int size = 0, end = 0, i = 0, j = 0;
+    char c = 0;
+
+    generateSquarePolybius(polybius, key);
+
+    for (i = 0; i < POLYBIUS_SIZE; i++){
+        for (j = 0; j < POLYBIUS_SIZE; j++)
+            printf("%c ", polybius[i][j]);
+        printf("\n");
+    }
+    // Open the file
+    f = fopen(filenameSrc, "r+");
+    if (f == NULL) return -1;
+
+    fDst = fopen(filenameDst, "w");
+    if (fDst == NULL) {
+        fclose(f);
+        return -1;
+    }
+    do {
+        end = readFile(f, &size, data);
+
+	    /********* Encryption **********/
+        for (i = 0; i < size; i++){
+            if (data[i] >= 'a' && data[i] <= 'z')
+                c = data[i] - 32;
+            else c = data[i];
+
+            for (j = 0; j < POLYBIUS_SIZE; j++){
+                for (int x = 0; x < POLYBIUS_SIZE; x++){
+                    if (c == polybius[j][x]){
+                       fputc(j + '0', fDst);
+                       fputc(x + '0', fDst);
+                    }
+                }
+            }
+            if (c == '\n' || c == ' '){
+                fputc(c, fDst);
+                fputc(0, fDst); // For having a couple of number
+            }
+        }
+
+        size = 0; 
+        memset(data, 0, BUFFER_SIZE);
+        memset(dataEncrypted, 0, BUFFER_SIZE);
+    }while(end != 1);
+
+	/* Close files */
+    fclose(f);
+    fclose(fDst);
+    return 0;
+}
+int decryptPolybius(const char *filenameSrc, const char *filenameDst, const char *key){
+    char polybius[POLYBIUS_SIZE][POLYBIUS_SIZE];
+    FILE *f = NULL, *fDst = NULL;
+    char data[BUFFER_SIZE];
+    char dataEncrypted[BUFFER_SIZE];
+    int size = 0, end = 0, i = 0, j = 0;
+
+    generateSquarePolybius(polybius, key);
+
+    for (i = 0; i < POLYBIUS_SIZE; i++){
+        for (j = 0; j < POLYBIUS_SIZE; j++)
+            printf("%c ", polybius[i][j]);
+        printf("\n");
+    }
+    // Open the file
+    f = fopen(filenameSrc, "r+");
+    if (f == NULL) return -1;
+
+    fDst = fopen(filenameDst, "w");
+    if (fDst == NULL) {
+        fclose(f);
+        return -1;
+    }
+    do {
+        end = readFile(f, &size, data);
+
+	    /********* Decryption **********/
+        for (i = 0; i < size; i += 2){
+            if (data[i] >= 48 && data[i] <= 53) {
+                int c1 = data[i] - '0';
+                int c2 = data[i+1] - '0';
+                char c = polybius[c1][c2];
+                printf("%c", c);
+                fputc(c, fDst);
+            }
+            else{
+                printf("%c", data[i]);
+                fputc(data[i], fDst);
+            }
+        }
+
+        size = 0; 
+        memset(data, 0, BUFFER_SIZE);
+        memset(dataEncrypted, 0, BUFFER_SIZE);
+    }while(end != 1);
+
+	/* Close files */
+    fclose(f);
+    fclose(fDst);
+    return 0;
+
+}
+/*
+ This function fill the polybius square
+ */
+static void fillSquare(int pos, int *posPolybius, char *p, char polybius[POLYBIUS_SIZE][POLYBIUS_SIZE]){
+    for (int i = 0; i < POLYBIUS_SIZE; i++){
+        polybius[pos][i] = p[*(posPolybius)];
+        *posPolybius = *posPolybius + 1;
+    }
+}
+static int findKeyInSquare(const char *polybius, char c){
+    // We exclude the 'J' character
+    for (int i = 0; i < ALPHABET_SIZE - 1; i++)
+        if (c == polybius[i])
+            return 1;
+    return 0;
+}
+/*
+ This function generate the polybius square
+ */
+void generateSquarePolybius(char polybius[POLYBIUS_SIZE][POLYBIUS_SIZE], const char *key){
+    char a[ALPHABET_SIZE - 1] = {0}; // The size is 25, we exclude the J character
+
+    int pos = 0;
+    for (int i = 0; i < strlen(key); i++){
+        char k;
+        if (key[i] >= 'a' && key[i] <= 'z')
+            k = key[i] - 32; // 32 = 26 + special characters
+        else k = key[i];
+        int res = findKeyInSquare(a, k);
+        if (res == 0)
+            a[pos++] = k;
+    }
+    int n = 0;
+    int t = pos;
+    for (int i = pos; i < ALPHABET_SIZE + pos; i++){
+        char c = 'A' + n;
+        if (c == 'J'){
+            // We check if I is in the array, if yes, we do not add it
+        }
+        /*if (c == 'I'){
+            // We check if J is in the array, is yes, we do not add it
+            int res = findKeyInSquare(a, 'J');
+            // J not in the array, we add it
+            if (res == 0){
+                a[t++] = 'A';
+            }
+        }*/
+        if (c != 'J'){
+            int res = findKeyInSquare(a, c);
+
+            if (res == 0)
+                a[t++] = c;
+        }
+        n++;
+    }
+    pos = 0;
+    fillSquare(0, &pos, a, polybius);     
+    fillSquare(1, &pos, a, polybius);     
+    fillSquare(2, &pos, a, polybius);     
+    fillSquare(3, &pos, a, polybius);     
+    fillSquare(4, &pos, a, polybius);     
+}

src/polybius.h

@@ -0,0 +1,15 @@
+#ifndef H_POLYBIUS
+#define H_POLYBIUS
+
+#include <stdio.h>
+#include <string.h>
+#include "functions.h"
+
+#define POLYBIUS_SIZE 5
+#define ALPHABET_SIZE 26
+
+int cryptPolybius(const char *, const char *, const char *);
+int decryptPolybius(const char *, const char *, const char *);
+void generateSquarePolybius(char polybius[5][5], const char *);
+
+#endif

src/vigenere.c

@@ -5,7 +5,6 @@ int cryptVigenere(const char *key, const char *fileSrc, const int numberCharacte
 	char matrice[SIZE_MATRICE_VIGENERE][SIZE_MATRICE_VIGENERE];
 	char *data = malloc(sizeof(char) * numberCharacters);
 	char *dataVigenere = NULL;
-	char c = 0;
 	int pos = 0;
 	size_t i, j = 0;
 	size_t keyLength = strlen(key);